《口袋妖怪红宝石386》中登场了386只口袋妖怪，玩家可单机就能获得全部的386只妖怪。 游戏的故事发生在天元镇，玩家将在这里展开怪兽捕捉、培养以及成为口袋妖怪训练师的旅途。 游戏保留了系列许多经典的设定，冲浪、属性相克等。